Провели приёмку, а остатки на сайт не ушли - скорее всего, обмен не обработал документ оприходования или сломался на этапе выгрузки остатков. Разбираю такие кейсы через трассировку правил обмена и прямые запросы к OData или HTTP-сервисам Битрикса.Какая схема обмена используется - стандартная через план обмена или самописный механизм? Настраивал интеграции 1С с сайтами через HTTP-сервисы и Конвертацию данных 2/3.