Стоимость оборудования - цена, по которой реализуется товар. с него процент считается дальше.
Сумма да, считается отдельно по строкам - т.е. с работ например 15% вышло, с продажи оборудования - ещё 10% от оборудования и т.п..
Как влияет доставка - она учитывается в расходах, т.е. менеджер может выбрать более дешёвый вариант доставки и больше заработать.