как нам говорят рекомендации настраивать сервер 1с это не вариант, он с коробки сам работает, со скулем примерно такая же история, ему главное аппаратные мощности. Вам надо перейти с файловой базы на SQL, и потом провести анализ что именно у вас тупит, возможно просто SQL частично решит вашу проблему построив соответствующие индексы и ускорив тем самым вашу базу.
судя по ошибке она возникает в запросе, если у вас база распределенная надо обновить конфигурацию, если не распределенная то либо на всех рабочих местах такое должно быть, либо все таки на этом месте попробовать удалить, подключить по новой базу, попробовать почистить серверный кеш(база клиент-сервер). Если перечисленные меры не помогут, надо лезть в конфигурацию смотреть что там в запросе не так написано.